I Stockholm planeras en ny terminalbyggnad i samband med utbyggnad av Värtapiren. Programarbete pågår för terminalen och övriga byggnader som behövs för hamnens verksamhet.
Byggnaden uppfördes på 1920-talet som magasin. Efter ombyggnad till färjeterminal flyttade rederier med trafik till Estland och Lettland in.
Frihamnsterminalen Magasin 2 i Stockholm har trafik till Estland och Lettland. Fr o m 2008 ingår dessa länder i Schengensamarbetet. Till följd av detta kommer invändiga förändringar att ske i terminalen.
Färjeterminalen byggdes i början av 1980-talet och trafikerar Åland, Finland, Estland och Lettland. Den krafigt ökande trafiken över Östersjön till de baltiska länderna medförde i början på 2000-talet ett behov av utökade ytor.
Nybyggnad på ca 1800 kvm beläget inom hamnområdet i Nynäshamn. Byggnaden innehåller en tullvisitationshall för lastfordon samt en verkstadshall och lager för hamnens verksamhet.